| Versie | 1.01 |
|---|---|
| Uitgever | Paul A. Wilson |
| Datum van publicatie | 25 aug 2008 |
| Datum toegevoegd | 11 aug 2004 |
| OS-vereisten | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Voorwaarden | Mac OS X 10.3 |
| Totaal aantal downloads | 29 |
| Prijs | Free |
Omschrijving
Commandoregeltool voor het vergelijken van door komma's gescheiden gegevensbestanden met behulp van relatieve verschillen om de meest vergelijkbare conformaties te bepalen. Compsort vergelijkt de gegevensbestanden met behulp van relatieve verschillen, berekent een overeenkomstscore, sorteert de scores in oplopende volgorde (lagere waarden vertegenwoordigen grotere overeenkomst), slaat X aantal lage scores op.
De gegevensbestanden die door de gebruiker worden geproduceerd, moeten door komma's gescheiden tekstbestanden zijn. Elk bestand vertegenwoordigt een uniek molecuul. Elke rij in een bestand vertegenwoordigt een unieke conformatie van het molecuul. De eerste kolom in het gegevensbestand moet een label zijn dat uniek is voor de conformatie die door de rij wordt vertegenwoordigd. De rest van de kolommen zijn numerieke descriptoren, zoals afstandsruimtemetingen.
De rijen worden combinatorisch vergeleken tussen bestanden. De labels in vergelijking worden aaneengeschakeld en opgeslagen met de scores voor de reeks rijen. Dit biedt een manier om de conformaties te identificeren die een bepaalde overeenkomstscore opleverden.
Toekomstige werkzaamheden omvatten:
GUI-interface toevoegen
papier plaatsen op mijn 3D farmacofoor-modelleringsalgoritme
Een parallelle versie met MPI
