| Versie | 2.0.1 |
|---|---|
| Uitgever | Dhirendra Kumar |
| Datum van publicatie | 2 mei 2013 |
| Datum toegevoegd | 2 mei 2013 |
| OS-vereisten | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Voorwaarden | None |
| Totaal aantal downloads | 22 |
| Prijs | Free |
Omschrijving
GenoSuite is een raamwerk ontwikkeld voor proteogenomische analyse. Op FDRScore gebaseerde strategie wordt gebruikt om resultaten van meerdere zoekalgoritmen te integreren. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) is ontwikkeld als onderdeel van het GenoSuite-framework. PPT is voor het vinden van nieuwe vertalingen in prokaryotische genomen en is afhankelijk van op massaspectrometrie gebaseerde proteomics-gegevens en gerelateerde genoomsequenties. Functies omvatten geconfigureerd voor 4 open source-algoritmen om database-zoekopdrachten uit te voeren voor peptide-identificatie en elke combinatie van de 4 algoritmen kan worden gekozen, geeft een overzicht van de genoomzoekspecifieke peptiden (nieuwe peptiden), spectrale overeenkomsten kunnen worden gevisualiseerd voor de kwaliteitsbeoordeling, lijsten uit de nieuwe eiwitten en veranderingen in de bestaande eiwitannotaties, en een visuele genomische context van de nieuwe peptiden kunnen ook worden gegenereerd.
