| Versie | 1.1.5 |
|---|---|
| Uitgever | MultiGeneBlast |
| Datum van publicatie | 3 apr 2013 |
| Datum toegevoegd | 4 apr 2013 |
| OS-vereisten | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Voorwaarden | None |
| Totaal aantal downloads | 95 |
| Prijs | Free |
Omschrijving
MultiGeneBlast is een open source-tool gebaseerd op een herformattering van de FASTA-headers van NCBI GenBank-eiwitingangen, waarmee het hun bronnucleotide en -coördinaten kan opsporen. MultiGeneBlast kan helpen bij de detectie van dergelijke multigene delen voor synthetische biologieprojecten. Een synthetische bibliotheek van operons kan worden gecreëerd op basis van de uitvoer om die operons te identificeren waarvan de functie het dichtst bij de door de gebruiker gewenste functie ligt. Deze tool biedt de mogelijkheid om alle homologe genomische regio's te identificeren door de resultaten van enkele BlastP-runs op elk gen te combineren en genomische regio's van elke GenBank-invoer te sorteren op het aantal hits, synteniebehoud en cumulatieve Blast-bitscore. Er kunnen architectuurzoekopdrachten worden uitgevoerd om alle genomische regio's te vinden met Blast-hits voor elke door de gebruiker gespecificeerde combinatie van aminozuursequenties.
