CodonCode Aligner

Omschrijving

CodonCode Aligner is gebruiksvriendelijke software voor assemblage, uitlijning, contig-editing en mutatiedetectie van DNA-sequenties. Aligner is compatibel met Phred-Phrap en ondersteunt sequentiekwaliteitsscores volledig, terwijl het een vertrouwde, gemakkelijk te leren gebruikersinterface biedt. Functies omvatten het importeren van sequenties uit tekstbestanden, het uitlijnen van contigs met elkaar terwijl de links naar de sporen behouden blijven, het vinden van heterozygote mutaties, het definiëren van interessegebieden ("features"), het importeren en bewerken van door Phrap gegenereerde samenstellingen, het exporteren van sequenties en functies, het importeren van sequenties van ABI- en SCF-bestanden, vector trimmen, uitlijnen op een referentiesequentie, heterozygote invoegingen en verwijderingen analyseren, navigeren tussen door de gebruiker gedefinieerde functies en Consed-compatibele assemblageprojecten exporteren.