| Uitgever | David Rosenkranz |
|---|---|
| Datum van publicatie | 6 mei 2013 |
| Datum toegevoegd | 6 mei 2013 |
| OS-vereisten | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Voorwaarden | None |
| Totaal aantal downloads | 64 |
| Prijs | Free |
Omschrijving
proTRAC is een uniek en handig hulpmiddel voor probabilistische piRNA-clusterdetectie, visualisatie en analyse. proTRAC vertoont een hogere gevoeligheid en selectiviteit in vergelijking met tot nu toe toegepaste methoden voor clusterdetectie. De significantie van de waargenomen sequentie-leeshitdichtheid, strengbias, hoeveelheid loci die overeenkomt met niet vaak in kaart gebrachte sequentielezingen, hoeveelheid loci met T op positie 1 of A op positie 10 en de hoeveelheid loci binnen het typische piRNA-lengtebereik (26- 32nt) worden in aanmerking genomen. De waargenomen kenmerken van clusterkandidaten worden geëvalueerd in het licht van de gegeven dataset en zijn onderworpen aan een probabilistisch scoresysteem.