Ascalaph Designer

Omschrijving

Ascalaph Designer is een algemeen programma voor moleculaire dynamische simulaties. Onder een enkele grafische omgeving worden weergegeven als hun eigen implementatie van moleculaire dynamica, evenals de methoden van klassieke en kwantummechanica van populaire programma's. Functies omvatten moleculaire afbeeldingen: meerdere vensters, twee camera's per model, CPK, draadframe, Stick, Ball and Stick en CPK Draadframestijlen, moleculaire modelbouw: kristalbouwer, kettingbouwer, tekenen met de muis, moleculaire geometrie bewerken, voorlopige optimalisatie , kwantumoptimalisatie en verwijdering van botsingen, optimalisatie van moleculaire geometrie met geconjugeerde gradiëntmethoden, moleculaire dynamica: integratie van meerdere tijdstappen, integratie van de vierde orde, supercomputerberekeningen met behulp van MDynaMix, flexibel SPC-watermodel en impliciet watermodel, en kwantumchemie met hulp van CP2K en PC GAMESS/Firefly: energie, optimalisatie van moleculaire geometrie en potentieel afgeleide ladingen.