Arlequin

Omschrijving

Arlequin biedt de gemiddelde gebruiker in populatiegenetica een vrij groot aantal basismethoden en statistische tests om informatie over genetische en demografische kenmerken van een verzameling populatiestalen te extraheren. De grafische interface is zo ontworpen dat gebruikers snel de verschillende analyses kunnen selecteren die ze op hun gegevens willen uitvoeren. We vonden het belangrijk om de data te kunnen verkennen, om meerdere keren dezelfde dataset vanuit verschillende perspectieven te analyseren, met verschillende geselecteerde opties. De statistische tests die in Arlequin zijn geïmplementeerd, zijn zo gekozen dat ze verborgen aannames minimaliseren en zo krachtig mogelijk zijn. Ze nemen dus vaak de vorm aan van ofwel permutatietests of exacte tests, met enkele uitzonderingen. Omdat Arlequin een rijke set aan functies en veel opties heeft, betekent dit dat de gebruiker wat tijd moet besteden aan het leren ervan.