Pedimap

Omschrijving

Pedimap is een hulpmiddel voor het onderzoeken en visualiseren van de stroom van fenotypes en allelen (geobserveerd of gebaseerd op Identity-by-Descent-berekeningen) door middel van stambomen. Het heeft tools voor de handmatige en automatische selectie van delen van de stamboom op basis van criteria zoals voorouders en/of nakomelingen tot een bepaald aantal generaties, langs de moeder-, vader- of beide lijnen, broers en zussen etc. Voor elke selectie kunnen meerdere weergaven worden gegenereerd om verschillende koppelingsgroepen, fenotypische eigenschappen enz. weer te geven. Zodra een weergave voor één selectie is gemaakt, kan deze automatisch opnieuw worden gemaakt voor elke andere selectie. Pedimap kan omgaan met zowel numerieke als tekstuele fenotypische scores, en met zowel polyploïden als diploïden. De genetische informatie kan worden weergegeven volgens genetische koppelingskaarten, vandaar de naam.