POY

Omschrijving

POY is een fylogenetisch analyseprogramma dat meerdere soorten gegevens ondersteunt (bijv. morfologie, nucleotiden, genen en genregio's, chromosomen en hele genomen). POY is bijzonder omdat het echte uitlijning en fylogenie-inferentie kan uitvoeren, d.w.z. invoersequenties hoeven niet vooraf te worden uitgelijnd. Invoegingen, verwijderingen en herschikkingen kunnen vervolgens worden opgenomen in de algehele boomscore onder Maximale spaarzaamheid, of in het model onder Maximale waarschijnlijkheid. Hiervoor zijn verschillende heuristische algoritmen ontwikkeld en geïmplementeerd in POY.